参照吉水县城站历史数据，水南镇地区四季分明，冬冷夏热，降水高度集中。

冬季（12—2月）日均高温仅11—14℃，低温在3—6℃左右，2024年1月24日曾出现-5℃的极端低温；夏季（7—8月）日均高温可达35—38℃，2022年7月25日出现过40℃的极端高温。

降水分配极不均匀：4—6月是全年雨量最集中的时段，例如2022年4月单月降水量达474mm，2024年4月更达到1312.9mm，雨日数在13—29天之间，连续阴雨和暴雨过程频繁。

7—8月尽管高温，但2022年8月雨日仅3天，2025年7—8月雨日偏多且降水强度大，显示出夏季降水年际波动明显。

10月至次年1月为相对干季，月降水量普遍在50mm以下，部分月份甚至无降水。

由于水南镇地处山区丘陵，河谷、山坡地带晨间和傍晚易出现雾，体感较县城更为湿凉，尤其冬春季节早晚温差偏大；夏季虽高温与县城接近，但山林地带午后雷阵雨可能更频繁。